下、分子動力学（MD）シミュレーションによって、蛋 白質の立体構造や酵素反応性、蛋白質間の相互作用に 与える分子混雑環境の影響を分子レベルで解明するこ とを目的としている。 本課題は、理研・杉田理論分子科学研究室（杉田
1. はじめに 高分子溶液に関する熱力学的性質の研究は，まず高分子 物質の分子量測定法の確立を目的として始められた。1) 高分 子は気体にならないので，初期の高分子研究では沸点上昇 法，凝固点効果法，浸透圧法などの希薄溶液の 分子動力学計算（MD）とは？MDトラジェクトリ-を利用した 化合物スクリーニング 神戸大学計算生命科学の基礎Ⅱ 生命科学と理工学の理工学の融合によ る生命理解と健康・医療への応用 分子動力学計算を活用した インシリコ創薬 SAMsを形成する分子の条件としては、1)基板表面の金属 原子と反応する官能基を有すること、2)自己組織化的に集合 し、高密度な薄膜を形成する分子間相互作用を有することであ る。チオール誘導体の場合、1)はチオール(-SH)やジス 2009/08/05 ゲノム分子生物学2講義概要(2007年秋学期) 水曜日9:25～10:55 講師金井昭夫akio@sfc.keio.ac.jp 講師中東憲治knakahig@sfc.keio.ac.jp 講師柘植謙爾ktsuge@ttck.keio.ac.jp SATTCK側松井君、北村さん SFC側 喜久田さん、高根さん
遺伝子DNAを細胞から取り出し、人工的な操作を加えたり、それを利用して遺伝子産物（タンパク質）を細胞につくらせる技術を遺伝子工学（gene technology, genetic engineering）、遺伝子操作（gene manipulation）、遺伝子組み換え技術（recombinant DNA technique）などと呼ぶ。 2015/07/21 分子・ナノ・マイクロレベルの 構造制御に関する新技術 JST-ERATO ・東京工業大学 彌田智一 新技術説明会 2015/022 説明課題 1. 分子量や分散度の制御および合成の際の 遷移金属触媒の使用低減が可能なパイ共 役系高分子の新規合成法 下、分子動力学（MD）シミュレーションによって、蛋 白質の立体構造や酵素反応性、蛋白質間の相互作用に 与える分子混雑環境の影響を分子レベルで解明するこ とを目的としている。 本課題は、理研・杉田理論分子科学研究室（杉田 高橋 肇 1) 2) 3) 1) 東京海洋大学大学院 2) 海洋科学技術研究科 3) 食品微生物学研究室 今回開発を行ったのは、高分子が複数種混合(ブレンド)された系にさらに球形ナノ粒子が充填された材料について、相分離構造やナノ粒子の分散構造をできるだけ簡単にシミュレーションし、1マイクロメートルスケールの領域における構造を短時間でシミュレーションするソフトウエアである。 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析 大滝大樹 長崎大学大学院医歯薬学総合研究科 分子標的医学研究センター 1．はじめに タンパク質は生命の重要な構成単位の1つであり，その生化学的機能の発現には固有の立体構
バイオシグナル分子を固定化した細胞成長促進ハイプリッド材料の合成 ………………… 45. 京都大学工学部 よびラン藻からクローニングされた△ 12脂肪酸不. 飽和化酵素遺伝子(JJ£SA) 8) Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. : Molecular cloning: a 2-3-1 Lb. acetotolerans HT の LDH 遺伝子のクローニング. 30 生分解性プラスチックとして研究の対象となっている高分子物質は主に、①微生物. 生産系：糖などを Sambrook, J., Fritsch, E.F., and Maniatis, T. (1989) “Molecular cloning: A Laboratory. ジ、http://www.mhlw.go.jp/shingi/2008/07/dl/s0704-8c.pdf. 34) 藤崎亨、食品 3) Maniatis, T., Fritsch, E. F., Sambrook, J., Molecular Cloning, Cold Spring 素や部位変位体作成による解析から分子の中央領域、特に 171 残基目のアミノ酸残基がヌ N 末端延長ペプチドデリーションクローンを発現させたところ、すべて活性型酵素が得ら. 2016年4月14日 こちらは方向性クローニング用ベクター(公開番号 特開2016-052338号)の詳細情報です。 作用可能に連結したラムノース誘導プロモーターを含む組換えＤＮＡ分子を有する組換え宿主細胞を、ラムノース、及び、対象のＤＮＡ配列に作用可能 1990) 0 2分子の ALAは重合してポルフォピリノーゲンとなり、さらにこれが 4分子重合. することにより 腸菌 hemG遺伝子変異株を相補する cDNAクローンを選択することによって、シロイヌナ. ズナのプロトポル 本研究で使用したプラスミドクローンおよびファージクローンを表 2-2に示す。大腸菌. ゲノム上の forsometRNAnonsensesuppressors.Mol.Gen.Genet.193:38-45. Sambrook，. J.，. E.F.Fritsch，. andT.Maniatis.1989. MI:}の分子fiHIこ適したマーカ -ilift、子の株寸ミと 11(r'~ iri. 伝子のm1-: 内で のMぷIIJUjjJ{ム fのクローニングかなされている。 a e 、is e d ヨ12~: Saccharomycesce巴込sia空のエチオニン耐性遺伝下のクローニング. とs-アデノ は、 Maniatisらのん7):3 2)に従勺て 1jなった。 lUJち、 RNA 12. 39(1975). 32) T. Maniatis.E.F.FritschandJ. Sambrook: "MolecularCloning.a laboratorymanual".NewYork， 1982. 33) H. Ito，
遺伝子DNAを細胞から取り出し、人工的な操作を加えたり、それを利用して遺伝子産物（タンパク質）を細胞につくらせる技術を遺伝子工学（gene technology, genetic engineering）、遺伝子操作（gene manipulation）、遺伝子組み換え技術（recombinant DNA technique）などと呼ぶ。 2015/07/21 分子・ナノ・マイクロレベルの 構造制御に関する新技術 JST-ERATO ・東京工業大学 彌田智一 新技術説明会 2015/022 説明課題 1. 分子量や分散度の制御および合成の際の 遷移金属触媒の使用低減が可能なパイ共 役系高分子の新規合成法 下、分子動力学（MD）シミュレーションによって、蛋 白質の立体構造や酵素反応性、蛋白質間の相互作用に 与える分子混雑環境の影響を分子レベルで解明するこ とを目的としている。 本課題は、理研・杉田理論分子科学研究室（杉田 高橋 肇 1) 2) 3) 1) 東京海洋大学大学院 2) 海洋科学技術研究科 3) 食品微生物学研究室 今回開発を行ったのは、高分子が複数種混合(ブレンド)された系にさらに球形ナノ粒子が充填された材料について、相分離構造やナノ粒子の分散構造をできるだけ簡単にシミュレーションし、1マイクロメートルスケールの領域における構造を短時間でシミュレーションするソフトウエアである。
大学を中心に教科書として愛用されて15年！ 今までの高分子の教科書は難しすぎた。高分子の学問としての 体系を崩さず、本質を基礎から分かりやすく解説。 これから高分子を学ぼうとする方の入門書に、また次世代の 化学者を育てる立場の方の指導書に。
